| Saidah | Arabie saoudite | Site archéologique | — |
| Salakta | Tunisie | Village | — |
| Saldae | Algérie | Site archéologique | — |
| Salkhad | Syrie | Village | — |
| Salt | Jordanie | Ville | — |
| Samarra | Irak | Site archéologique | — |
| Sanctuaire d'Apollon | Libye | Temple | — |
| Sanctuaire de Bel | Syrie | Temple | — |
| Sanctuaire de Loth | Jordanie | Grotte | — |
| Sanctuaire de Rabban Boya | Irak | Site archéologique | — |
| Sanctuaire de Thinissut | Tunisie | Site archéologique | — |
| Sanctuaire phénicien de Kharayeb | Liban | Sanctuaire | — |
| Sanctuaire taillé dans la roche | Libye | Grotte | — |
| Sans titre | Maroc | Site archéologique | — |
| Sbeïtla | Tunisie | Site archéologique | — |
| Segermes | Tunisie | Site archéologique | — |
| Seigneurie de Mirabel | Israël | Parc national | XXIe siècle |
| Sepphoris | Israël | Village | — |
| Serjilla | Syrie | Site archéologique | — |
| Sghedeida | — | — | Ier siècle av. J.-C. |
| Shaduppum | Irak | Tell | — |
| Shaizar | Syrie | Village | — |
| Shanidar | Irak | Grotte | — |
| Shheem | Liban | Petite ville | — |
| Shibaniba | Irak | Tell | — |
| Shikhin | Israël | Site archéologique | — |
| Shivta | Israël | Site archéologique | — |
| Shnan | Syrie | Village | — |
| Shuruppak | Irak | Établissement humain | — |
| Shusharra | Irak | Tell | — |
| Sicca | Tunisie | Site archéologique | — |
| Sidi Jdidi | Tunisie | Site archéologique | — |
| Sidi Nuah | — | — | Ier siècle av. J.-C. |
| Siga | Algérie | Site archéologique | — |
| Sijilmassa | Maroc | Établissement humain | VIIIe siècle |
| Silo | État de Palestine | Tell | — |
| Siloam | Israël | Site archéologique | — |
| Sippar | Irak | Établissement humain | — |
| Siq al-Barid | Jordanie | Site archéologique | — |
| Sirwah | Yémen | Site archéologique | — |
| Site archéologique d'El Brayech | Maroc | Site archéologique | — |
| Site archéologique de Jawatha | Arabie saoudite | Site archéologique | — |
| Site archéologique de Kish | Irak | Site archéologique | — |
| Site archéologique de Sabratha | Libye | Site archéologique | — |
| Site archéologique de Susya | État de Palestine | Ruine | — |
| Site archéologique du Jabal Says | Syrie | Site archéologique | — |
| Site protohistorique de Kach Kouch | Maroc | Site archéologique | — |
| Sites archéologiques de Bat, Al-Khutm et Al-Ayn | Oman | Forteresse | — |
| Sitifis | — | — | Ier siècle |
| Sitt er-Rum (Syria) | — | — | — |
| Slonta | Libye | Temple | — |
| Snemat | — | — | Ier siècle av. J.-C. |
| Snibat el-Awila | — | — | VIe siècle av. J.-C. |
| Sokho | Israël | Site archéologique | — |
| Songor | Irak | Site archéologique | — |
| Soueïda | Syrie | Ville | — |
| Source d'Elisée | État de Palestine | Source | — |
| Spy Hasar | Irak | Site archéologique | — |
| Stratégéion | Libye | Temple | IVe siècle av. J.-C. |
| Sululos | Tunisie | Site archéologique | — |
| Suq Wadi Barada | Syrie | Site archéologique | — |
| Sura | Syrie | Site archéologique | — |
| Synagogue d'ed-Dikke | Israël | Synagogue | — |
| Synagogue d'Eshtemoa | État de Palestine | Site archéologique | — |
| Synagogue de Gaza | État de Palestine | Site archéologique | VIe siècle |
| Synagogue de Hammath | Israël | Réserve naturelle | XXe siècle |
| Synagogue de Maon | Israël | Synagogue | — |
| Synagogue de Nabratein | Israël | Site archéologique | — |
| Synagogue de Wadi Qelt | État de Palestine | Site archéologique | — |
| Séfar | Algérie | Site archéologique | — |
| Séleucie du Tigre | Irak | Site archéologique | IVe siècle av. J.-C. |
| Sérapéum | Libye | Temple | — |
| Sôzousa | Libye | Site archéologique | — |
| Sīdī al Buḩayrī | — | — | Ier siècle av. J.-C. |
| Sīrat Rālis | — | — | Ier siècle av. J.-C. |